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Whistleblower reprend l'histoire qui a mené à Outlast, et s'étend au-delà des événements du premier jeu pour montrer le véritable chapitre final de l'histoire de Mount Massive Asylum.
Outlast : Whistleblower suit l'histoire de Waylon Park, l'ingénieur logiciel sous contrat avec la Murkoff Corporation qui envoie des e-mails à des journalistes du monde entier - dont Miles Upshur - au début d'Outlast.

Vous rencontrerez Waylon quelques semaines après son arrivée à Mount Massive, période pendant laquelle il n'a même pas pu contacter sa femme et son fils en raison de protocoles de sécurité très stricts. Ayant développé une profonde méfiance à l'égard des scientifiques et médecins motivés par le profit et menant des expériences dangereuses et irresponsables sur leurs patients, Waylon finit par déclencher les événements qui conduiront à démasquer le cœur pourri de Mount Massive.